Аннотация
Введение. Эпигенетическая модификация с участием метилирования промоторных CpG-островков служит тонким и динамичным механизмом регуляции экспрессии генов в опухолях. Повышенная и пониженная экспрессия и изменение статуса метилирования гена рассматривают как первичные критерии онкогенной или супрессорной функции гена и как факторы прогноза рака. Цель исследования. Оценка вклада метилирования в регуляцию экспрессии группы функционально важных генов хромосомы 3 при раке молочной железы (РМЖ); определение новых генов с чертами онкогенов или супрессоров, перспективных как прогностические маркеры. Методы. Образцы опухолевой и окружающей гистологически неизмененной ткани от 69 больных РМЖ собраны и клинически охарактеризованы в РОНЦ РАМН. Содержание мРНК генов определяли методом полуколичественной обратной транскрипции – полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР). Анализ метилирования ДНК проводили с применением 2 метилчувствительных рестриктаз – HpaII и HhaI и последующей полимеразной цепной реакции (ПЦР). Результаты. Показана двоякая роль метилирования у генов GPX1, NKIRAS1, RHOA, DAG1 и USP4 с преобладанием опухолей с повышенной экспрессией, что характерно для онкогенов. Впервые установлена значимая корреляция между изменением уровня мРНК и структурными изменениями (метилированием/деметилированием и делециями/амплификациями) (p<10-17 по Спирмену) для генов GPX1, NKIRAS1 и RHOA, и предварительно – для DAG1 и USP4. Вклад метилирования в дерегуляцию экспрессии детектирован у NKIRAS1 в 69% (18/26), DAG1 – 67% (4/6), USP4 – 83% (5/6), GPX1 – 34% (11/32), RHOA – 16% (5/32) образцов опухолей. Онкогенные свойства наиболее выражены у генов NKIRAS1, RHOA и DAG1, у которых доминировал повышенный уровень мРНК, ассоциированный с деметилированием или амплификацией локуса. Заключение. Впервые показано, что изменение статуса метилирования генов GPX1, NKIRAS1, RHOA, DAG1 и USP4 может влиять на уровень экспрессии в первичных опухолях больных РМЖ. Выявленные особенности генов NKIRAS1, RHOA и DAG1 (повышенный уровень мРНК, деметилирование или амплификация) могут быть использованы для разработки новых подходов к прогнозированию РМЖ.
Авторы и аффилиации
В.И. Логинов (1), кандидат биологических наук, И.В. Пронина (1), кандидат биологических наук, А.М. Бурденный (1), кандидат биологических наук, Д.С. Ходырев (2), кандидат биологических наук, Т.П. Казубская (3), доктор медицинских наук, Э.А. Брага (1), доктор биологических наук, профессор, А.А. Кубатиев (1), академик РАН, профессор, Н.Е. Кушлинский (3), член-корреспондент РАН, профессор
1 -Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии РАМН, Российская Федерация, 125315, Москва, ул. Байкальская, д. 8;
2 -Федеральный Научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий ФМБА России, Российская Федерация, 115682, Москва, Ореховый бульвар, д. 28;
3 -Российский онкологический научный центр им. Н.Н. Блохина РАМН, Российская Федерация, 115478, Москва, Каширское шоссе, д. 24
E-mail: eleonora10_45@mail.ru